1/ Khi thanh kiểm tra phải có quyết định thanh kiểm tra của Cơ quan Thuế có thẩm quyền. Doanh nghiệp có quyền không tiếp nếu không có quyết định chính thức.

2/ Có hợp lý khi có nhiều cuộc thanh tra trong một năm ? Thanh tra không quá 1 lần 1 năm ? Tham khảo chỉ thị 20/CT-TTg

Nếu cùng tính chất thì chỉ được thanh tra cùng một nội dung trong năm, không được trùng nội dung thanh kiểm tra trong cùng năm. Ví dụ thanh tra thuế và thanh tra môi trường trong cùng 1 năm cho cùng 1 đơn vị thì không vi phạm quy định. 

3/ Quyền của người bị thanh tra ?

Nếu không đồng ý với kết luận thanh tra, doanh nghiệp cần ghi vào biên bản, doanh nghiệp không đồng ý khoản nào, điểm nào để làm bằng chứng. Sau đó, doanh nghiệp làm khiếu nại gởi cơ quan có thẩm quyền, lưu ý thời hạn khiếu nại. Nếu khiếu nại không được, muốn khiếu nại ra Tòa, doanh nghiệp nên làm văn bản thông báo rút lại khiếu nại để đưa ra Tòa. Tuy nhiên, nên có khiếu nại rồi mới ra Tòa.

4/Thời hiệu truy thu thuế ?

Thời hiệu tối đa truy thu thuế là 10 năm theo Luật quản lý thuế.

5/Thời hiệu phạt hành chính thuế ?

Phạt hành chính thuế có thời hiệu tối đa 5 năm.

6/Thời hiệu phạt châm nộp thuế ?
Không giới han thời gian và hiện là 0.03%/ngày.

7/Quyết định thanh tra, công bố biên bản kiểm tra.....có thời hạn cụ thể căn cứ Luật quản lý thuế

Quyết định thanh kiểm tra: trong vòng 10 ngày, đội thanh kiểm tra phải lập Biên bản thông báo quyết định kiểm tra có sự xác nhận của 2 bên. Thời gian thanh kiểm tra là 5 ngày, đội thanh tra có thể đề nghị với Cơ quan thuế để kéo dài thời gian kiểm tra tối đa 30 ngày, kết thúc thời gian này phải có Biên bản thanh, kiểm tra thuế ký xác nhận hai bên. Kết thúc cuộc thanh, kiểm tra sẽ có Quyết định về việc xử lý vi phạm về thuế qua việc thanh, kiểm tra.

8/ Trong cuộc thanh, kiểm tra thuế, cơ quan thuế không có chức năng phạt hành chính về kế toán. Ví dụ: doanh nghiệp hạch toán sai, cơ quan thuế thanh, kiểm tra phát hiện sẽ có chức năng phạt doanh nghiệp. Cơ quan thuế có thể đề nghị Sở tài chính phạt. 

9/ Văn bản liên quan đến thanh kiểm tra thuế cần tham khảo:
-Chỉ thị 20/CT-TTg ngày 17/05/2017 xem tại đây
-Kiểm tra thuế: quyết định 746/QĐ-TCT ngày 20/04/2015 xem tại đây
-Thanh tra thuế: quyết định 1404/QĐ-TCT ngày 28/07/2015 xem tại đây, quyết định 2605/QĐ-TCT ngày 30/12/2016  xem tại đây

-Thông tư 156 hướng dẫn Luật quản lý Thuế